Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB35Q15286 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB35Q15286 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB35Q15286 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms