Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIXQ14938 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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