Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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ERV3-1Q14264 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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ERV3-1Q14264 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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ERV3-1Q14264 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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ERV3-1Q14264 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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ERV3-1Q14264 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERV3-1Q14264 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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