Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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EBI3Q14213 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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EBI3Q14213 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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EBI3Q14213 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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