Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms