Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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