Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX3Q13761 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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