Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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