Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAD4Q13485 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD4Q13485 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms