Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
XRCC4Q13426 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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