Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SP140Q13342 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP140Q13342 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP140Q13342 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SP140Q13342 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP140Q13342 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SP140Q13342 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SP140Q13342 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SP140Q13342 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP140Q13342 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP140Q13342 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP140Q13342 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP140Q13342 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP140Q13342 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SP140Q13342 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP140Q13342 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP140Q13342 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP140Q13342 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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