Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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RPA4Q13156 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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RPA4Q13156 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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RPA4Q13156 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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