Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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NR1H3Q13133 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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NR1H3Q13133 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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NR1H3Q13133 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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NR1H3Q13133 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR1H3Q13133 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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