Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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