Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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