Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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