Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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