Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF2Q12947 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms