Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRJQ12913 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.1 ms