Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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