Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms