Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms