Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-1Q07627 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms