Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PAX8Q06710 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms