Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CNTN2Q02246 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CNTN2Q02246 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CNTN2Q02246 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms