Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms