Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK6Q00534 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms