Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A1P68400 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms