Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RPS29P62273 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RPS29P62273 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
RPS29P62273 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
RPS29P62273 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
RPS29P62273 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
RPS29P62273 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms