Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCR4P61073 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms