Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG3P56975 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms