Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA2P54646 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms