Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERFP50548 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERFP50548 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERFP50548 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERFP50548 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERFP50548 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERFP50548 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERFP50548 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERFP50548 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERFP50548 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERFP50548 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms