Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms