Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ALDH9A1P49189 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ALDH9A1P49189 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms