Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NESP48681 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NESP48681 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NESP48681 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NESP48681 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NESP48681 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NESP48681 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NESP48681 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NESP48681 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NESP48681 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NESP48681 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NESP48681 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NESP48681 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NESP48681 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NESP48681 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NESP48681 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NESP48681 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NESP48681 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NESP48681 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NESP48681 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NESP48681 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NESP48681 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NESP48681 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NESP48681 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NESP48681 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NESP48681 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NESP48681 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NESP48681 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NESP48681 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NESP48681 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NESP48681 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms