Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT6CP48668 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT6CP48668 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT6CP48668 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT6CP48668 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT6CP48668 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT6CP48668 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT6CP48668 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT6CP48668 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT6CP48668 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT6CP48668 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms