Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms