Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCAMP43121 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCAMP43121 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MCAMP43121 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms