Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms