Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF2P35227 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms