Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA4P35212 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA4P35212 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA4P35212 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms