Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP5DP30049 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms