Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms