Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms