Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2P0DI81 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC2P0DI81 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms