Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFLP07196 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFLP07196 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFLP07196 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFLP07196 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms