Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRB1P04280 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRB1P04280 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRB1P04280 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRB1P04280 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRB1P04280 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRB1P04280 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRB1P04280 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRB1P04280 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRB1P04280 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRB1P04280 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRB1P04280 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRB1P04280 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRB1P04280 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRB1P04280 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRB1P04280 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRB1P04280 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRB1P04280 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRB1P04280 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms