Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PF4P02776 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PF4P02776 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PF4P02776 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PF4P02776 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PF4P02776 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PF4P02776 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PF4P02776 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PF4P02776 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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