Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC1P02654 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC1P02654 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms